Онкотест Foundation One – своевременная диагностика рака
Рак – заболевание, при котором злокачественные клетки «вытесняют» доброкачественные. Злокачественные клетки появляются вследствие мутации генов, которая их активирует/деактивирует. В результате этого начинает вырабатываться белок, который не выполняет положенные ему функции.
Мутация в ДНК приводит к выработке белка, который не контролирует размножение клеток и препятствует их естественной гибели. Накопление клеток приводит к образованию опухоли. При лечении онкозаболевания лекарства воздействуют на этот белок.
ДНК и злокачественные опухоли
ДНК – строго определенная последовательность генов, которая расположена в ядре любой клетки. Она программирует правильную работу всего организма. При нарушении этой последовательности или при сбое в работе ДНК начинается бесконтрольное деление здоровых клеток или неестественная длительность их жизненного цикла. Неумеренное накопление клеток, вызванное нарушением клеточной ДНК, называют злокачественной опухолью.
Классическая схема лечения пациентов с одной и той же локализацией опухоли – облучение, блоки химиотерапии. В этом случае гибели подвергаются не только злокачественные, но и здоровые клетки.
Последние исследования доказывают, что даже при сходной локализации мутации носят индивидуальный характер, поэтому важно понимать, какой именно белок вырабатывается и оказывает воздействие на клетки. Это позволяет подобрать лечение, которое будет иметь максимальную пользу при минимальном вреде для организма.
Онкотест Foundation One: назначение
Определить конкретную мутацию ДНК и белок позволяет тест Foundation One. Благодаря ему врач легко может назначить правильное лечение и таргетную терапию. Тестирование проводится американской лабораторией Foundation Medicine.
Отправку образцов производит клиника «Онкотест-Тева», которая тесно сотрудничает с лабораторией Foundation Medicine. Через 14-21 день результаты тестирования приходят одновременно пациенту и лечащему врачу. Отчет также содержит рекомендации, связанные с последующим лечением. Они основаны на последних медицинских открытиях и клинических исследованиях.
Полученные результаты позволяют лечащему врачу:
- узнать характеристики конкретной опухоли (структуру белка, конкретные изменения структуры ДНК), спрогнозировать течение заболевания;
- подобрать лекарственные препараты, прошедшие клинические исследования.
Грамотно подобранные препараты воздействуют на конкретный белок в клетке, «заставляя» его функционировать правильно, тем самым достигается ремиссия заболевания.
Клинические исследования
При проведении теста используется новейшая методика секвенирования. Исследователь рака Липсон с ее помощью обследовал 24 опухоли немелкоклеточного рака легкого. В 71% были получены результаты, которые позволили подобрать эффективное лечение. Также при тестировании было произведено открытие, при котором происходит слияние генов KIF5B-RET. Подобная мутация ранее не была известна. Развернутое исследование показало, что из 520 пациентов с НМРЛ у 3% присутствует подобное отклонение.
Разновидность теста Foundation One
Foundation One – это набор следующих исследований:
- Tissue Panels (тканевые выборки) – в качестве биоматериала используют ткани опухоли.
- Liquid Panels (жидкостные выборки) – исследуют кровь на наличие следов опухоли, ее разновидности.
- Ultra-Coverage Genomic Proteomic (всеохватывающие геномно-протеомные) – изучается геном или его часть с целью выявления связей злокачественного белка с другими белками организма.
Tissue Panels (тканевые выборки)
Нарушения ДНК могут наблюдаться как в нескольких генах, так и в одном. При тканевой выборке в качестве биологического материала выступает ранее удаленная опухоль, хранящаяся в медицинском учреждении. Поэтому нет необходимости для повторной биопсии. Исключением является малое количество материала или длительный период после терапии. Дополнительно берется слюна пациента с целью сравнения здоровых и больных клеток.
Благодаря инновационному методу Next Generation Sequencing (NGS) удается одномоментно обнаружить мутации различных видов в разных группах генов. В этом случае каждый участок гена исследуется до 1500 раз, что позволяет получить результаты с точностью 99,9%. Под каждый вид мутации подбирается свое биологическое лечение.
Возможности тестирования:
- одиночный ген;
- выборка из 88 генов;
- выборка из 203 генов.
Liquid Panels (жидкостные выборки)
Ученые выяснили, что раковые клетки высвобождают фрагменты своей ДНК в кровь человека, поэтому, благодаря методу цифрового секвенирования, можно обнаружить эти фрагменты и исследовать их гены. Метод показан в таких случаях:
- невозможно получить биопсию опухоли;
- наличие метастаз;
- для наблюдения динамики пациента, реакции организма на предложенную терапию.
Общегеномное/экзомное секвенирование клеток опухоли Ultra-Coverage Genomic Proteomic
Данный метод применяется в случае невозможности сделать выборку генов. Тогда сканированию подлежит весь геном или экзома (место расположения генов).
Во время проведения теста исследуется ДНК 350 генов и РНК 250 генов. Для этого используется инновационный метод New Generation Sequencing (NGS). Он позволяет определить перестановки, посторонние включения, делеции пар нуклеотидов.
В 85% случаев исследуемых образцов удалось правильно подобрать лечение нужными препаратами, что в итоге дало отличные результаты.
Онкотест Foundation One – первый шаг к выздоровлению!